总RNA提取

目录

1 拼音

zǒng RNA tí qǔ

2 注解

Trizol Reagent处理法

3 原理

分离纯净、完整的RNA分子对于分子克隆的实验是很重要的,而且是进行基因表达分析的基础。在总RNA中,75-85%为rRNA(主要是28S-26S/23S和18S/16S rRNA),其余的由分子量大小和核苷酸序列各不相同的mRNA和小分子RNA如tRNA、snRNA及snoRNA等组成。

为了获得高质量的RNA,必须要控制RNA酶的活性,也就是要避免RNA酶的污染。RNA酶很稳定,而且反应不需要辅助因子,因而在RNA的制备过程中只要存在少量的RNA酶就会导致实验的失败。为避免RNA酶的污染,实验中所用到的全部溶液、玻璃器皿、塑料制品等都需要特别处理。

RNA酶的抑制剂主要有异硫氰酸胍、焦碳酸二乙酯(DEPC,使用浓度为0.05%-0.1%)、钒氧核糖核苷复合物(10mmol/L)、蛋白质抑制剂RNasin。实验中采用DEPC对所用到的溶液、玻璃器皿和塑料制品等进行处理。

4 仪器与试剂

仪器

烧杯(1000,500,100,50mL若干);量筒(1000,500,250,50,20mL若干);玻璃棒、药勺、试剂瓶、三角瓶、吸头(1000,200,20微升)、吸头盒、离心管(1.5mL,0.2mL)、冷冻高速离心机、紫外分光光度计等。

试剂

灭菌的DEPC水、氯仿:异戊醇(24:1)、异丙醇、75%乙醇、Trizol Reagent、

5 实验步骤

准备工作:用DEPC(1ml/L)水溶液处理枪头、离心管等24hr,然后高温灭菌2次,每次20min;研钵、剪刀等其他用具在180℃下烘3hr。

1、组织匀浆,在液氮中将组织研碎后,加入500μl Trizol后再充分研磨,用枪头将粉末转移到离心管中,加入500μl Trizol后用注射器抽打均匀,室温下放置5min;

2、加200μl氯仿,剧烈振荡15sec,颠倒几次,室温下放置15min;

3、4℃下12,000rpm离心15min;

4、转移上清液至一新的离心管(DEPC处理)中,加500μl异丙醇,振荡混匀,室温下放置5~10min;

5、4℃下12,000rpm离心8min;

6、弃上清液,加1ml 75%乙醇,漩涡混匀(或加无水乙醇以加快挥发);

7、4℃下7,500rpm离心5min;

8、弃乙醇,空气风干3~5min,用DEPC处理过的水(先在55~60℃水浴10~15min)溶解,根据沉淀的量,一般加入30~50μl;

9、RNA质量的检测,取1μlRNA样品稀释100倍后测定RNA浓度及OD260/280;

10、RNA保存于-80℃冰箱。

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