与“转录“有关的文献报道

细胞在进行转录(transcription) 过程中的关键步骤。据相关的科学界人士指出，这一个过程虽然属于细胞生理活动的一个基本动作，但关键的运作机制却不为人所知，这次研究人员所获得的突破，不但厘清了细胞将 DNA分子，转录生成 R

的启动子区域存在多样的分支转录现象。 对大部分的基因来说与RNA聚合酶II相连的转录起始位点都被认为是单向性的。在本研究中，麻省理工等处的研究小组找出充足的证据证实编码蛋白的基因启动子区存在有分支转录的现象。转录起始位点与RNAs相连的区

iology上。 细胞核中DNA的转录是一个极为复杂的过程，它发生在由上百个蛋白构成的酶工厂中。这种工厂部分由蛋白质组成，一旦装配成功，转录立刻开始。尽管研究人员对这个转录开始前的复合体了解较多，但是对于它的组分以及这些组

进行分析，研究人员发现造血干细胞中转录因子PU.1的表达有明显的变化，并且flk2-和flk2+共同骨髓祖细胞中PU.1表达的模式不同。 这项分析还揭示出在被研究的细胞群中，GAPDH转录本水平存在明显的差异。这项研究是对

别在体外转录出正义和反义RNA，再将两者退火，形成双链RNA。体外合成的双链RNA可以用脂质体转入细胞中。但有些细胞脂质体转移效果差，转移到细胞内的双链RNA半衰期短。 这个方法的不足之处是实验的规模受到限制，虽然一次体外转录合成能提

法发现了转录因子Tbx6的一个新的相互作用蛋白--Smad6。进一步的研究发现Smad6通过增加Tbx6泛素化修饰，进而抑制Tbx6的转录活性。 T-box基因家族是近十年来新发现的一类在胚胎早期发育和遗传性疾病中起重要作用的转录调控因子

殊的DNA序列时。例如，在转录终止区，DNA链可完全重复螺旋化，而酶的RNA链则从复合体中释放出。而在质粒ColEL复制时，RNA引物的转录生成的情形则正相反，在某一特异位点处DNA的重复螺旋化被阻止，生成的转录本和模板DNA形成几百核苷

uropilin-2的表达，Neuropilin-2可以使中间神经元入侵到发育中的纹状体。 这项研究成果证明，细胞命运的决定因素Nkx2-1调节神经细胞迁移的方式是在细胞分裂后直接转录调控的介导受体。（科学网 武彦文/编译） 作者：

究表明，聚合酶II终止转录过程必需RNA 3'端的多聚腺苷酸信号〔poly(A)〕， RNA前体的转录后剪切加工也和转录终止过程相关。另外，在β球蛋白基因的的3'侧还发现了专一性的转录终止信号。这说明聚合酶II转录终止过程涉及多种因素，

科学家们亲眼目睹了活组织中的基因转录过程，这一最新的研究成果在线发表在8月号的《自然—结构和分子生物学》期刊上。 RNA聚合酶II是一种将DNA信息转录到信使RNA的酶，由这种酶所实施的转录是基因表达的核心，也是生物调控机

结构，并且通过另外的生化和基因实验，提供了一个TRCF和转录延伸复合物（transcription elongation complex）相互作用的模型。这些结果为细菌DNA转录偶联修复（bacterial transcriptio

转录（一个细胞的DNA模板的一个序列的互补性RNA版本的生成）正在成为一个比仅仅在几年前所认为的要更为复杂的过程。例如，“RNA聚合酶暂停”是普遍存在的，从而为各种不同调控过程提供一个焦点，而且很多转录副本注定要迅速退化。 为了研究

合物和增强子结合时，其附近的启动子即起始转录。 RNA聚合酶Ⅲ的启动子 一般说，启动子均位于转录起点的上游。但后来发现，在由RNA聚合酶Ⅲ转录的5SRNA基因中，其启动子位于转录单位之中，在转录起点的下游50个碱基以后。一般说，5SR

可以使NF－κB核转录因子开始活跃起来。 目前用于抑制NF－κB核转录因子活性的药物有类固醇制剂等，但是这类药物同时也作用于其他蛋白，由此会引发多种副作用。而岩井一宏等人的实验显示，聚泛素似乎只作用于NF－κB核转录因子。这些研究人员

”关闭。 现在，FLC的非编码反义RNA转录体被发现存在于冷处理的种子中，并对温度变化有响应，这说明它们在低温感应和FLC沉默中有可能扮演一个角儿。这种类型的反义转录事件（源自基因的3′端）也许是调控相应“正义”转录的一个普遍机制。 作者：

可激活INV启动子的转录并可介导依赖TPA的转录活性增强，C/EBP可与AP1、ets及AP2因子一起协同调节hINV近侧启动子的转录活性[15]。此外，C/EBP可与BPV-4长控制区中的负性调控元件结合，使病毒转录受到阻遏，若此应答元

个重要因素是其抑制效应的寿命。以前，RNAi诱导的转录沉寂作用的遗传只在一代小鼠身上被发现。现在，研究人员发现，线虫Caenorhabditis elegans的一次RNAi所诱发的转录沉寂作用，能在没有这种诱发因素和没有RNAi机器的

时启动程序保护细胞免受损害。采用热,研究人员能够在几秒内快速启动DNA的解折叠及热休克基因的转录。 当温度升高时，一种叫做热休克因子的蛋白推动转录发生所必须的步骤。Petesch和Lis发现,热休克因子结合到热休克基因并激活了涉及一些关键

注点放在泛素（ubiquitin）分子上。泛素到达位点后似乎会抑制已经聚集好的转录机器进行转录。泛素一旦离开，核心中携带RNA聚合酶II的转录机器获得自由，转录过程被启动。研究过程是在酵母（一种经常被用于遗传研究的模式生物）中进行的。

目的，其中很多应激反应基因依赖于σ54因子，它们能和启动子DNA结合形成一个稳定的封闭复合物，这对于转录过程很重要。转录的开始需要结合于转录起始位点上游的激活蛋白驱动的ATP水解。在2008年11月7日出版的《分子细胞》（Molecular

物学的明星分子，它们是基因表达、修饰、转录和翻译的调节者。无论是在动物模型还是植物模型上，科学家们都发现microRNA对多种生命过程具有重要的调控作用。 miRNA与siRNA相似，它们是调控基因转录后调节的重要因子。siRNA的沉默基因

与分子链相连而构建mRNA。他们直接观察和计量了基因转录涉及到的主要步骤，它们分别是起始、延伸和终止。 辛格表示，对酵母菌中基因转录的观察显示，转录起始似乎是一个随机事件，它依赖于转录因子是否能成功地在酵母细胞核中寻找到一个特殊的基因启

转录行为，但其功能与RNA媒介转录衰减机制相反，并通过RNA间的相互作用来执行调控基因活性和转录的功能。研究人员随后在最普通的埃希氏菌属大肠杆菌（Escherichia coli）中验证了其功能。 阿金说：“这种变体只是对天然RNA转录

存在极大差异。进一步研究证明MOF-MSF 1v1是一种无论体内，还是体外实验中，p53靶基因获得最佳转录活性的必需因子，这些研究结果提出了一种新型的作用模型：两个MOF复合物能与其它组蛋白修饰活性因子一起调控转录活性的不同阶段。 作者：

苷酶，透过酶和乙酰基转移酶。原核生物中没有核模，所以转录与翻译是连续进行的，往往转录还未完成，翻译已经开始了，因此原核生物中转录生成的mRNA没有特殊的转录后加工修饰过程。 真核生物转录生成的mRNA为单顺反子，即一个mRNA分子只为一种

BS），即转录因子调节基因表达时与mRNA结合的区域（比如TATA box），是重要的转录调控元件。在研究过程中TFBS十分重要，比如说如果研究人员想要查清楚一种特异转录因子是如何导致一种疾病的，就需要定位出基因组上每一个转录因子结合位

分化。作者在文章中提出了这样一个机制：输入蛋白－α在细胞未分化状态下选择性地让转录因子Oct3/4入核，在分化状态下选择性地让转录因子SOX2入核，这种细胞内转录因子的差异运输为细胞分化的进行提供了独特的调控机制。 *输入蛋白(imp

步骤，在cDNA的每一端都产生一个包含有18个核苷的两端标记。这些配对端点双标记测序技术可用于快速测序，对于一个既定的转录片段来说，每次可进行36个核苷的测定，而且能揭示其首尾信息。 不久以后，他们集合PET和ChIP两者的

学遗传学和病理学系的Mats Nilsson等首先将mRNA转变成cDNA分子，再用锁式探针和RCA检测，从而实现了转录本的原位检测（图1）。根据研究人员的分析，这种方法能够鉴定出多个基因中的单个突变。这对混合了正常细胞和癌细胞的肿瘤分析

细胞中发现了几千个新的转录本（大部分是非编码RNA）。这些新检测到的转录本与转录起始和延伸的信号密切相关，在这些转录本上游，科研人员看到了H3K4me3,RNAPII结合位点和CAGE等标志转录起始的特征。而且这些转录本的基因组位置、外显子

D与TATA盒的结合，提高转录效率；但不是转录复合体一定需要的。 图 RNA聚合酶Ⅱ转录复合体的形成示意图 以上所述是典型的启动子上转录复合体的形成，但有的真核启动子不含TATA盒或不通过TATA盒开始转录的。例如有的无TATA盒的

P1基因启动子转录活性的影响。结果发现在CV—1细胞中，AML1-ETO对p21WAF1／CIP1基因启动子的转录具有明显的抑制作用，在pCMV5-AML1-ETO的剂量为1000ng时，p21WAF1／CIP1启动子的转录活性下降为对照

基因转录成RNA时，聚合酶延伸到超过蛋白编码的部分，来形成“3?未翻译区域” (UTR)，该区域含调控性序列并帮助翻译。腺嘌呤长束被添加到3? UTR，转录组测序的标准方法基于 “poly(A)”尾巴的杂合。Jan等人报告了转录组测

的研究人员，日前成功绘制了人体正常细胞中转录因子之间相互发挥作用的示意图。 研究人员调查了人体约２０００种转录因子中的１２２２种。在这份示意图中，转录因子用点来表示，如果两种转录因子之间存在相互作用，就用线条把相应的两

期、细胞微环境以及内在转录“噪音”等差异的影响。事实上，从细菌到人类的所有模型生物体中基因表达均具有随机性。这一部分是由于单个细胞的大多数基因中，基因组DNA模板仅有一个（原核生物）或两个（大多数真核生物）拷贝用于转录，且启动表达的分子事件

关系，及其在转录调控中的作用。该工作通过整合同一细胞株和条件下同一转录因子的全部ChIP-chip/seq数据和与之匹配的全部差异表达数据，建立了一个新的模型预测转录因子直接调控的基因。该工作提出了不同类型高通量数据整合研究转录调控机制的新

鼠基因组进行系统的研究。研究人员可以利用这一芯片对转录因子和其它蛋白结合结构域进行研究。最近更有研究人员利用Affymetrix的嵌合芯片在过去认为是垃圾DNA的区域中间找到了许多以前从未发现过的转录活性区域（生物通记者 谢菲）。 作者：

研究人员研究了转录因子中氨基酸取代对基因调控的影响。 基因组cis-调控区域中的变化在基因调控的演化中起重要作用。Lynch等人研究了转录因子中的氨基酸取代对基因调控的影响。他们发现了在演化过程中，“干系”胎生哺乳动物的转录因子CEBPB