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“嘌呤型”三螺旋DNA

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1 拼音

“piào lìng xíng ”sān luó xuán

2 注解

“嘌呤型”或嘌呤-嘌呤-嘧啶型(R·RY)三螺旋中,第三条嘌呤链以反平行于Watson-Crick双螺旋嘌呤链的方向缠绕到双螺旋的大沟上,专一性地与嘌呤链结合。例如,典型的R·RY型三螺旋G·GC和A·AT,其相应的结构单元三碱基体(图3-26);其专一性体现在G对GC、A对AT的识别。

早期,在利用光谱学和超分离测量方法探索三链复合物时发现了G·GC和I·IC两种R·RY型三螺旋。后来,Fresco等用亲和色谱法确认R·RY型三螺旋中也包括A·AU∕I、I·AU∕T和I·GC三螺旋。随后,又确认了G·GC、A·GC和T·AT 3种典型的R·RY型三螺旋,以及C·AT、A·GC和T·CG等相互作用较弱的三螺旋。研究发现R·RY型三螺旋(C·AT、A·GC和A·AT等)第三条嘌呤链和Watson-Crick双螺旋的嘌呤链以两个反-Hoogsteen氢键相连接,且糖环的二面角限制在anti区。

核磁共振实验在研究R·RY型、内含一个T·CG三碱基体的G·GC三螺旋(Karen, 1994)时,发现所有的糖环构象包括T·CG的转化位点,均采取接近于C2′-endo的堆积形式。在三螺旋中,C2′-endo的糖环构象在每一条链上的分布按下列顺序增加:嘧啶型<双螺旋的嘌呤链<第三条嘌呤链。从目前的情况看,有关糖环构象以及R·RY型三螺旋整体结构尚需详细研究。

在R·RY型三螺旋中,第三条核苷酸链的加入引起了扭转角和X位移的变化。结果显示,此三螺旋既不同于通常的A型也不同于B型DNA。双螺旋的碱基对向小沟方向移动了约19nm(原文为"-19nm"疑为"波浪线19nm"),以此来容纳大沟上的第三条链(图3-27)。总之,三螺旋中的双螺旋区似乎并未受到第三条链太大的影响,而且双螺旋区的碱基堆积形式有些像A型DNA。然而与A型DNA不同的是双螺旋区的大部分核苷酸的糖环构象是S型而非N型,R·RY型三螺旋的详细结构仍需进一步研究。

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    2020/2/25 4:02:01 | #0
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本页最后修订于 2010年3月17日 星期三 22:17:46 (GMT+08:00)
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